首页 | 用户登录 | 旧版网站 | 加入收藏

科学研究

您当前的位置>科学研究>科研信息

学术报告(Jin Liu 助理教授 4.3)

日期:2017-03-28浏览次数:559

学术报告(Jin Liu助理教授  4.3

 

题 目: A Summary-Statistics-based Random Effect Model to Estimating heritability, co-heritability and effect sizes in GWAS data analysis

报告人: Jin Liu(Assistant Professor,Duke-NUS Medical School

时 间:2017年4月3日 下午:10:30——11:30

地 点:数学楼415报告厅



讲座简介:Most existing methods for GWAS data analysis require individual-level genotype data as their input. However, it is often not easy to get access to individual-level data, due to many practical issues, such as privacy protection and disagreement on data-sharing among multiple research groups. In this talk, we introduce SSREM, a Summary-Statistics-based approach to estimating heritability, co-heritability and effect sizes in GWAS data analysis.  This is achieved by Bayesian analysis with the standard random-effect prior and a summary-statistics-based likelihood function. We have implemented a parallel Gibbs sampling strategy, which allows us to handle genome-wide-scale datasets. Our analysis results suggest that summary-statistics-based analysis can achieve comparable performance to individual-level data analysis.